Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms