Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNE4Q8N205 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms