Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUD2

ERC1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERC1Q8IUD2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ERC1Q8IUD2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERC1Q8IUD2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms