Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC84Q86UT8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms