Protein–RNA interactions for Protein: Q86US8

SMG6, Telomerase-binding protein EST1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6Q86US8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG6Q86US8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms