Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRCQ7RTU9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms