Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms