Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL35Q6PF15 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms