Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms