Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATL3Q6DD88 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms