Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGNBP1Q5YKI7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms