Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF123Q5XPI4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms