Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CARMIL1Q5VZK9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL1Q5VZK9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms