Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C9orf84Q5VXU9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms