Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms