Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDGFL1Q5TGJ6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms