Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms