Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF19Q5T6S3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms