Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms