Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms