Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY2Q49AN0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms