Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI54

KRTAP19-8, Keratin-associated protein 19-8, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-8Q3LI54 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP19-8Q3LI54 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms