Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms