Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q1T7F1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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