Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CCDC142Q17RM4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CCDC142Q17RM4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CCDC142Q17RM4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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