Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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NRF1Q16656 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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NRF1Q16656 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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NRF1Q16656 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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NRF1Q16656 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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NRF1Q16656 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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NRF1Q16656 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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NRF1Q16656 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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NRF1Q16656 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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