Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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