Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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