Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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