Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ZFHX3Q15911 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZFHX3Q15911 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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ZFHX3Q15911 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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ZFHX3Q15911 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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ZFHX3Q15911 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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ZFHX3Q15911 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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ZFHX3Q15911 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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ZFHX3Q15911 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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ZFHX3Q15911 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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