Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6AP1Q15904 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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