Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.495e-18■■■■■ 31.6
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SF3B4Q15427 NCL-206ENST00000454824 606 ntTSL 36.29□□□□□ -1.45e-18■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 ORMDL1-205ENST00000442547 893 ntTSL 54.5□□□□□ -1.695e-18■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.745e-18■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 NCL-204ENST00000436894 562 ntTSL 44.04□□□□□ -1.765e-18■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 31.6
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SF3B4Q15427 CORO7-223ENST00000574311 1737 ntTSL 515.42■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 31.6
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SF3B4Q15427 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 CORO7-208ENST00000571227 3578 ntTSL 512.14□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 31.6
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SF3B4Q15427 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 31.6
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SF3B4Q15427 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 31.6
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SF3B4Q15427 RAB5B-205ENST00000549034 558 ntTSL 28.68□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 31.6
SF3B4Q15427 NGLY1-203ENST00000308710 2086 ntTSL 1 (best)7.48□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 31.6
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SF3B4Q15427 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-10■■■■■ 31.6
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SF3B4Q15427 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-10■■■■■ 31.6
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SF3B4Q15427 ANKRD23-205ENST00000476975 1132 ntTSL 512.26□□□□□ -0.451e-10■■■■■ 31.6
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SF3B4Q15427 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.465e-9■■■■■ 31.5
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SF3B4Q15427 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.73e-7■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 TAZ-211ENST00000494912 2286 ntTSL 216.96■□□□□ 0.316e-8■■■■■ 31.5
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SF3B4Q15427 ACADM-216ENST00000534146 654 ntTSL 412.98□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 WNK4-206ENST00000592669 581 ntTSL 411.25□□□□□ -0.613e-22■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 ACADM-207ENST00000525881 914 ntTSL 210.9□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 B3GNTL1-202ENST00000570947 390 ntTSL 310.14□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 WASH3P-203ENST00000558686 561 ntTSL 417.06■□□□□ 0.321e-25■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 WASH3P-201ENST00000354296 955 ntTSL 211.51□□□□□ -0.571e-25■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 WASH3P-205ENST00000559163 772 ntTSL 511.51□□□□□ -0.571e-25■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 WASH3P-206ENST00000559884 427 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.871e-25■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 CPSF4-211ENST00000471455 569 ntTSL 58.44□□□□□ -1.068e-8■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 ATG4B-224ENST00000494132 828 ntTSL 213.27□□□□□ -0.299e-13■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 ARAP1-208ENST00000452383 994 ntTSL 313.52□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 ARAP1-206ENST00000427971 1101 ntTSL 512.03□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 ELP2-224ENST00000543861 555 ntTSL 45.98□□□□□ -1.453e-12■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 ELP2-219ENST00000542050 690 ntTSL 33.21□□□□□ -1.93e-12■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 ELP2-217ENST00000541294 883 ntTSL 52.98□□□□□ -1.933e-12■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 GBA2-206ENST00000486797 772 ntTSL 512.61□□□□□ -0.396e-10■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 GBA2-207ENST00000488292 646 ntTSL 49.73□□□□□ -0.856e-10■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 CCDC137-204ENST00000574107 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.12■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 CCDC137-206ENST00000575223 1888 ntTSL 518.72■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 31.5
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