Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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