Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRS1Q15050 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms