Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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