Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms