Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms