Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms