Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGB1Q14028 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
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