Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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CKAP5Q14008 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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