Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX2Q13950 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX2Q13950 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms