Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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