Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P11Q13670 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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