Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSTA3Q13630 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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