Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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