Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms