Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms