Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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