Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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