Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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